潔凈室工程按用途可分為工業潔凈室和生物潔凈室，其主要應用領域如下：

　　

　　

　　以無生命微粒的控制為對象。主要控制空氣塵埃微粒對工作對象的污染，一般保持內部正壓。適用于精密機械行業、電子行業(半導體、集成電路等)等眾多行業。)，航天工業，高純化工，原子能工業，光磁產品工業(CD，膠片，磁帶生產)，LCD(液晶玻璃)，計算機硬盤，計算機磁頭生產等。

　　

　　

　　主要控制有生命微粒(細菌)與無生命微粒(塵埃)對工作對象的污染。并且可以分為：

　　

　　1、一般生物潔凈室：主要控制微生物(細菌)物體的污染。同時其內部材料應能承受各種消毒劑的侵蝕，內壓一般是有保證的。主要用于醫藥行業，醫院(手術室、無菌病房)、動物實驗室、理化檢驗室、血站等生產食品、化妝品、飲料產品。

　　

　　2、生物安全潔凈室：主要控制工作對象的生活顆粒物對外界和人的污染，并與內部大氣保持負壓。比如：細菌學、生物學、潔凈實驗室、生物工程(重組基因、疫苗制備)。

　　參考：中國潔凈室的分類